01. Fasa mudah alih
GC menggunakan gas sebagai fasa bergerak, juga dikenali sebagai gas pembawa. Gas pembawa yang biasa digunakan termasuk helium, nitrogen, dan hidrogen. Berbanding dengan HPLC, GC mempunyai lebih sedikit jenis fasa mudah alih dan julat pilihan yang lebih kecil. Fungsi utama gas pembawa adalah untuk memperkenalkan sampel ke dalam sistem GC untuk pengasingan, dan kesannya terhadap keputusan pengasingan adalah terhad.
Dalam HPLC, terdapat banyak jenis fasa mudah alih yang menyumbang besar kepada hasil pemisahan. Melihatnya dari perspektif yang berbeza, mengoptimumkan parameter operasi GC adalah lebih mudah daripada HPLC. Di samping itu, kos gas pembawa GC adalah lebih rendah daripada fasa mudah alih HPLC.
02. Fasa tetap
Disebabkan oleh jenis gas pembawa yang agak terhad dalam GC, selektiviti pemisahannya terutamanya diubah oleh fasa pegun yang berbeza, terutamanya dalam lajur GC yang dibungkus di mana fasa pegun selalunya terdiri daripada pembawa dan cecair tetap bersalut pada permukaannya, yang mempunyai kesan yang menentukan pada perpisahan. Oleh itu, ini telah membawa kepada pembangunan dan penyelidikan pelbagai jenis fasa pegun GC. Setakat ini, terdapat beratus-ratus fasa pegun GC yang tersedia untuk kita pilih, tetapi terdapat hanya sedozen fasa pegun HPLC yang biasa digunakan.
Oleh itu, LC sebahagian besarnya bergantung pada pemilihan fasa mudah alih yang berbeza untuk menukar selektiviti pemisahan. Sudah tentu, terdapat hanya sedozen fasa pegun yang biasa digunakan untuk GC kapilari. Dalam analisis praktikal, GC secara amnya memilih gas pembawa dan mengoptimumkan pengasingan dengan menukar lajur kromatografi (iaitu fasa pegun) dan parameter operasi (suhu lajur, kadar aliran gas pembawa, dll.), manakala LC sering mengoptimumkan pengasingan dengan menukar jenis dan komposisi fasa mudah alih dan parameter operasi (suhu lajur, kadar aliran fasa mudah alih, dsb.) selepas memilih lajur kromatografi.
03. Objek Analisis
Sampel yang boleh diasingkan secara langsung oleh GC adalah tidak menentu dan stabil dari segi terma, dengan takat didih umumnya tidak melebihi 500 darjah . Menurut statistik data yang berkaitan, 20% hingga 25% sebatian yang diketahui boleh dianalisis secara langsung oleh GC, manakala selebihnya boleh dianalisis oleh LC pada dasarnya. Maksudnya, GC mempunyai objek analisis yang jauh lebih sedikit daripada LC.
Perlu diingatkan bahawa beberapa sampel yang tidak boleh dianalisis secara langsung oleh GC juga boleh dianalisis secara tidak langsung oleh GC melalui teknik suntikan khas seperti suntikan ruang kepala dan suntikan pirolisis. Sebagai contoh, kromatografi retak bahan polimer adalah seperti ini. Ini sedikit sebanyak mengembangkan skop objek analisis GC. Selain itu, GC lebih sesuai untuk analisis gas daripada LC.
04. Teknologi Pengujian
Terdapat pelbagai teknik pengesanan yang biasa digunakan dalam GC, seperti pengesan kekonduksian terma (TCD), pengesan pengionan nyalaan (FID), pengesan tangkapan elektron (ECD), pengesan fosforus nitrogen (NPD), dan lain-lain. Antaranya, FID bertindak balas kepada kebanyakan organik sebatian dan mempunyai sensitiviti yang tinggi, dengan had pengesanan minimum sehingga nanogram.
Walau bagaimanapun, tiada pengesan yang sangat sensitif dengan kesejagatan yang baik dalam LC. Instrumen LC yang biasa dilengkapi untuk komoditi ialah pengesan penyerapan UV Vis dan pengesan indeks biasan (RI). Yang pertama adalah jauh kurang serba boleh berbanding FID dalam GC, dan yang kedua mempunyai kepekaan yang lebih rendah dan tidak sesuai untuk elusi kecerunan. Sudah tentu, kedua-dua GC dan LC mempunyai beberapa pengesan terpilih yang sangat sensitif,